Die Schulleitungskonferenz (SLK) ist operatives Führungs- und Vollzugsorgan der Schule Wohlen und fasst ihre Beschlüsse im Kollegialprinzip. Alle Mitglieder der SLK partizipieren am Entscheidungsprozess und somit auch an der gemeinsamen Verantwortung. Die SLK wird durch den Präsidenten vertreten. Zusammen mit dem Schulpflege-Präsidenten vertritt dieser die Schule gegen aussen.